本布图镇地处博湖县城东北6.5公里处，西距焉耆县城9公里，东临博斯腾湖，西接焉耆县和巴州种畜场，南临农二师25团，北面与塔温觉肯乡为邻。东西长约18.5公里，南北宽约10.5公里，总面积116.99平方千米。