有柄水苦荬，多年生草本，全体无毛，植株高10-20厘米，根茎长。总状花序短，长3-6厘米，有花10-20朵；花梗长3-10毫米，直或弯曲，几乎横叉开；花萼裂片卵状披针形，果期反折或多少离开蒴果；花冠淡紫色或淡蓝色，直径约5毫米。蒴果近圆形，长2-3毫米，宽2-4毫米，顶端凹口明显，花柱长1.5-2毫米。种子膨胀，有浅网纹。花期4-9月。