斑点刺尾鱼分布于印度-西太平洋区，西起西印度洋的大洋性岛屿，东至夏威夷、马贵斯等群岛，北至日本，南至澳洲大堡礁及新加勒多尼亚。台湾东北部、南部及东部离岛兰屿海域有产。