方巷镇位于江苏省扬州市北郊10公里处，距扬州西北绕城公路入口处4公里，距扬州铁路货运站6公里，与328国道接线的扬菱公路南北贯穿全镇。镇内邵伯湖畔有两座内河水运码头，水陆交通十分便利。