交配系统是指某一物种的个体之间按某种特定的方式进行交配的体系。动物的性别系统相对简单，雌雄同体现象十分罕见。而植物的性别系统十分多样，绝大多数被子植物都是雌雄同株，而大多数还是雌雄同花。交配（性别）系统对植物遗传发育的影响意义深远。