微型浮游生物是指大小约从5微米至60微米的浮游生物，如腰鞭毛藻，球石藻等。微型浮游生物小于小型浮游生物，大于超微型浮游生物。微型浮游生物主要包括二大类群，以单细胞、群体或丝状体形式出现，大多具有光合作用的浮游植物如微型藻类和细菌。有一些初级消费者属于微型浮游生物，如一些很小的原生动物。初级消费者与初级生产者同居在上层海水中，它们之间有较高的转换效率，一般初级消费者和初级生产者的生物量往往属于同一数量级。