巢湖市气象局的前身——原巢县忠庙气象站，建于1955年。巢湖行政公署1965年建制同时迁移至巢县北门，建制巢湖行政公署气象台。1974年升格巢湖行署气象局，2000年地级巢湖市成立更名市气象局。