九华山位于凤阳县府城镇镜内，南侧与安徽科技学院、凤阳师范学院及明朝开国皇帝朱元璋曾经出家的龙兴寺为邻，西南侧为明中都遗址，省道合蚌公路从治理区中部通过，城山有部队雷达站。