娘娘坝镇位于秦州区南部，东接麦积区麦积乡，南邻徽县麻沿镇，西与平南镇，大门镇接壤，北与齐寿镇、北道区甘泉镇毗邻，距秦城区43公里。境内地势起伏较大，西北高，东南低。最高海拔2169米，最低海拔687米。该镇地处西秦岭南麓，长江流域，地域广阔，气候湿润，雨量充足，年最高气温33.6℃最低气温-21.4℃，年无霜期154天，年平均降雨量691.3毫米。国道316线贯穿全镇，并有娘李、樊罗、董甘、刘大四条公路穿越全镇，交通方便。境内有娘娘坝和钱家坝两条河流，娘娘坝河发源于长江、黄河两大流域的分水岭的齐寿山，为嘉陵江的源头。