太湖短吻银鱼体细长，前部略呈圆筒形，后部侧扁，头部扁平，吻钝，呈弧形，体透明，无舌齿，背鳍起点距尾鳍基部小于至胸鳍基部的距离，离水后鱼体即变为乳白色，终生保持软骨，除性腺成熟时雄性个体的臀鳍基部上方面侧各有一列前大后小的鳞片外，通体无鳞，体短小，一般成体长度在5.0—7.0厘米，最大不超过8.4厘米，平均6.0厘米左右，体重在0.5—1.5克，平均0.8克左右。