土壤寄居菌（soil invaders）是指在土壤中病残体上存活期较长，但是不能单独在土壤中长期存活的微生物。多是植物或动物的寄生菌。土壤寄居菌必须在病株残体上营腐生生活，一旦寄主残体分解，便很快在其他微生物的竞争下丧失生活能力。