所谓基体效应，是指样品的化学组成和物理、化学状态的变化对待测元素的特征X荧光强度所造成的影响，大致可分为元素间吸收增强效应和物理、化学效应。元素间吸收增强效应与样品组成和仪器参数有关；物理效应主要表现在样品颗粒度、不均匀性造成的影响；化学效应主要表现在样品的矿物效应，即不同矿物形态对特征X荧光强度产生的影响。