古生物种（paleontologic species）是根据化石标本而建立的种。理论上古生物种的概念应与生物种相同，但古生物学研究的对象主要是石化了的生物硬体部分，古生物种的建立不可能采用生殖隔离标准，而多仅根据其形态特征的间断，甚至以部分形态特征为依据，故多为形态种。