怀柔区档案馆成立于1959年11月4日， 1966年8月“文化大革命”开始后被撤销，1980年1月恢复，1986年8月，改为档案局（馆）， 2002年4月，撤县设区，怀柔县档案局（馆）改称怀柔区档案局（馆），是怀柔区政府直属事业单位。档案馆是以集中保管怀柔地方政权组织机构档案为主的国家综合性档案馆。