南疆军区为正军级军区。南疆军区负责守卫新疆南部及边境治安和安全事务。隶属于中国五大战区之一的西部战区所下辖的新疆军区管辖。南疆军区始建于1951年11月，前身部队为红六军团、三五九旅和1950年组建的第二军。南疆军区成立近七十年来，与当地各族人民一起，为保卫新疆、建设新疆、维护社会稳定和发展地方经济艰苦奋斗，做出了不懈努力和杰出贡献。