潘伯顿于1831年出生在佐治亚州的诺科斯维尔城，17岁时就读于附近的佐治亚南方植物医药学院。毕业后当了一段时间的“蒸汽疗师”，他去费城以药剂师身份进修了一年，然后在佐治亚州的奥格尔索普市真正开始了他的药剂师生涯。