南京财经大学财税研究所新成立于2003年。本所的基本宗旨为坚持中性的研究立场，研究中国市场化和现代化过程中财政和税收制度建设的现实问题。研究的基本方法为制度比较方法和实证研究方法, 通过比较发达国家和发展中国家财政﹑税收制度建设的经验，探索构建我国财政﹑税收体制的路径。