属肠杆菌科志贺氏菌属，革兰氏染色阴性，无动力、在普通培养基上生长良好。适宜于低温潮湿的环境，对阳光直射、加热及一般消毒剂抵抗力差。根据生物化学反应及抗原组成分成4群：A群包括志贺氏菌及施氏志贺氏菌，B群包括弗氏志贺氏菌(8个血清型)，C群包括鲍氏志贺氏菌，D群为索氏志贺氏菌。各群均可产生内毒素，志贺氏志贺氏菌还可产生外毒素，因此，所致临床症状较重。20世纪末，志贺氏菌感染少见，中国某些地区仍有流行；弗氏志贺氏菌感染在中国占首要地位，且易转成慢性，排菌时间长；索氏志贺氏菌感染有增高的趋势，但感染较轻。