翼管神经切除术的机制在于切除鼻部的副交感神经，从而使鼻腔、鼻窦的血管处于收缩状态，同时鼻分泌物及泪腺分泌大为减少。切除翼管神经以后鼻粘膜上皮细胞固有层水肿减轻，上皮也恢复假复层状态，嗜酸粒细胞消失，肥大细胞脱颗粒减少。因此释放出的组胺、肝素和5-羟色胺等介质也减少，术后变态反应激惹试验可呈阴性。这些结果都是用于治疗过敏性鼻炎、血管舒缩性鼻炎和鼻息肉的理论根据。